Маринад с репчатым луком и морковью является, так сказать, классическим. То есть, его готовят практически все одинаково.
Но, да, из-за моркови и содержания в ней сахара в определённом количество, вкус такого маринада может меняться.
Вообще, если говорить о настоящем и "правильном" вкусе, то, как мне кажется, вкус здесь должен быть кисло-сладкий, то есть, сахар в морковке должен быть.
Сорт моркови важен, но только в том случае, если вам очень важно соблюдать пропорции вкуса именно сахаристостью моркови.
В противном же случае можно просто подсолить чересчур сладкий на ваш вкус маринад. И сорт моркови не окажет влияние.