Гнезда лука шалота выкапывают из почвы, затем разделяют на луковицы, лучше оставить просушить на солнце или в сухом помещении. Затем можно обрезать листья, или просто заплести сухие зеленые стебли лука в косы.
Хранить лук шалот в сухих холодных помещениях , а так же при комнатной температуре. ОН хорошо сохраняется в течение 5—7 месяцев. Есть любители сразу же после сбора чистят шалот, режут, замораживают и хранят в холодильнике возможно в пластиковых коробочках. Так же можно хранить и зелень лука.